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¿Qué es una promotora proximal?

Un promotor es una región proximal en el ácido desoxirribonucleico (ADN) justo antes del comienzo de un gen donde las proteínas y otras moléculas se unen en preparación para leer ese gen. La región promotora es esencial para la mayoría de los genes que se deben leer y transcritas en proteína, tanto en células procariotas y los eucariotas simples más complejas. Una variedad de proteínas llamadas factores de transcripción se unen al ADN en esta región, y realizar muchas tareas que se preparan para la transcripción de genes. La más importante de estas funciones es la construcción de un andamio de proteínas que contiene el ADN abierto y transcribe el gen adecuado al mismo tiempo.

La ubicación exacta y la estructura de un promotor proximal varía entre los genes y tipos de células. Las células procariotas, los que no tienen núcleo, por lo general tienen un tipo de promotor, mientras que las células eucariotas, los que tienen un núcleo verdadero, tienen otra. Los promotores generalmente se encuentran algunos nucleótidos aguas arriba de, o antes, el gen que controlan. Casi cada promotor contiene una secuencia especial de nucleótidos que lo identifica como tal. En general, los promotores procariotas se identifican por un grupo de nucleótidos llamada la secuencia de Shine-Dalgarno, y promotores eucariotas son identificados por una secuencia genética específica denominada la caja TATA.

A pesar de estas reglas relativamente simples, no todos los sigue promotor proximal, que puede hacer que la identificación de ellos, y los genes que controlan, algo difícil. La distancia entre un promotor y su gen no está fijado dentro de una especie o dentro de un solo organismo, por lo que la determinación de donde se sientan en relación con cada otro no es trivial. Composiciones secuencia promotora proximal no son siempre idénticos; Se puede muy de longitud, composición, o ambas cosas. Además, las secuencias marcadoras de la caja de Shine-Dalgarno o caja TATA tienen cierta variabilidad en ellos. ¿Cómo los factores de transcripción variadas reconocen los promotores en la cara de esta variabilidad inherente no es fácil de determinar, y nuevos ejemplos aparecen con frecuencia que cuestionan estas soluciones previamente robustos.

Cuando un gen está muy cerca de otro gen, existe la posibilidad de que su promotor proximal podría verse afectada por la acción del gen cercano. A veces, esto se hace a propósito en el genoma, tal vez para estimular múltiples genes a la vez o regular su acción de forma simultánea. En otras ocasiones, una conexión entre dos genes a través de la actividad de un promotor se hace en error. Para evitar que esto diafonía entre los genes en los que no se justifica, algunos genomas tienen regiones de aisladores entre ellos. Esta región extra no siempre es necesario, y algunos genomas evitar la diafonía por posicionamiento de genes de otras maneras, como forzar a un gen que sea inactivo mientras que otro es activo.

  • Tanto las células procariotas y eucariotas tienen promotores proximales.
  • Diversas proteínas denominadas factores de transcripción se unen al ADN en la región promotora proximal.